Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCM1Q15154 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms