Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL19A1Q14993 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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COL19A1Q14993 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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COL19A1Q14993 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL19A1Q14993 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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