Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP1BQ14684 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
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