Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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RBM39Q14498 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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RBM39Q14498 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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RBM39Q14498 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM39Q14498 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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