Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53BQ14153 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53BQ14153 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms