Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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COL9A2Q14055 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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