Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR4Q13639 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HTR4Q13639 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR4Q13639 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR4Q13639 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR4Q13639 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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