Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH18Q13634 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH18Q13634 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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