Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PEX6Q13608 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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