Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms