Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF6Q13247 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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