Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK2Q13002 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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