Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYO1EQ12965 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO1EQ12965 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 927.4 ms