Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANK3Q12955 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms