Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFIAQ12857 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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