Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFEMP1Q12805 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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