Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBL2Q08999 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBL2Q08999 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms