Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSC1Q08554 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSC1Q08554 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms