Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OC90Q02509 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OC90Q02509 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OC90Q02509 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms