Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDM2Q00987 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms