Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSG4Q00888 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG4Q00888 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms