Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYBPC1Q00872 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms