Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms