Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2L3P68036 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms