Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms