Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARFIP2P53365 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARFIP2P53365 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms