Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms