Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGIRP43119 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms