Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCAPD3P42695 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NCAPD3P42695 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCAPD3P42695 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCAPD3P42695 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCAPD3P42695 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NCAPD3P42695 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms