Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDH1P40925 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MDH1P40925 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDH1P40925 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDH1P40925 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDH1P40925 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDH1P40925 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms