Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP62P37198 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms