Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNA7P36544 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms