Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms