Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT9P35527 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT9P35527 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT9P35527 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT9P35527 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT9P35527 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT9P35527 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms