Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms