Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSPA4P34932 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms