Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP1P32455 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP1P32455 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP1P32455 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP1P32455 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP1P32455 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms