Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCR5P32302 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCR5P32302 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms