Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms