Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGA1P29973 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms