Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCAP28676 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCAP28676 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GCAP28676 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GCAP28676 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GCAP28676 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCAP28676 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCAP28676 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCAP28676 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms