Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFS1P28331 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFS1P28331 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms