Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YY1P25490 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YY1P25490 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YY1P25490 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YY1P25490 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YY1P25490 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YY1P25490 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
YY1P25490 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YY1P25490 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YY1P25490 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YY1P25490 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YY1P25490 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
YY1P25490 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YY1P25490 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YY1P25490 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YY1P25490 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YY1P25490 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YY1P25490 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YY1P25490 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YY1P25490 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YY1P25490 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YY1P25490 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YY1P25490 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YY1P25490 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YY1P25490 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YY1P25490 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YY1P25490 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YY1P25490 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms