Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRGP23470 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
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