Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2CP19387 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms