Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CPEP16870 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CPEP16870 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CPEP16870 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CPEP16870 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPEP16870 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPEP16870 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPEP16870 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPEP16870 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPEP16870 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms