Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH1P12830 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH1P12830 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH1P12830 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH1P12830 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH1P12830 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH1P12830 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms