Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L5P0DN76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms