Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms