Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHG4P01861 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHG4P01861 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms